云阳有2300余年建县历史。东周赧王元年（公元前314年），秦灭巴国置巴郡，在朐忍夷人之地建县名“朐忍”，是为本县建县之始。县治旧县坪（又名“旧县坝”，今双江镇建民村二社）。东汉献帝兴平二年（公元195年，以下省略“公元”和“年”字）属永宁郡。献帝建安六年（201）隶巴东郡。建安二十一年（216）改隶固陵郡 。蜀汉章武元年（221）属巴东郡。

    西晋和南北朝宋、齐、梁、西魏国，朐忍县名、隶属未变。北周天和三年（568）县治迁汤口（今云阳镇），更县名“云安”，隶巴东郡。隋开皇三年（583）隶信州。大业三年（607）还隶巴东郡。次年改隶夔州。天宝元年（742）属夔州云安郡。五代前蜀置安州，治今云安镇，隶镇江节度使（《中国历史地图集-五》P86 中华地图学社出版 1975年第一版））。后蜀国州废，置云安监，隶宁江节度使（《中国历史地图集-五》P86 中华地图学社出版 1975年第一版）。宋置云安军。宋末，军废县存，更隶夔州路。

    元至元十五年（1278），复置云安军，县仍为军治，隶夔州路。至元二十年（1283）省县入军，军改为州，名“云阳州”。至元二十三年（1286），州属夔路。

    明洪武四年（1371），州隶夔府。洪武六年（1373）十二月，州降为县，始为“云阳县”，属夔州。洪武九年（1376）隶重庆府。洪武十四年，更隶夔州府。清仍之。1917年起，先为国民革命军20军防地，后为国民革命军21军防地。1935年实行新县制，隶第九行政督察区万县专员公署。

    1949年12月6日，云阳县城和平解放。同月16日，成立云阳县人民政府，隶万县地区专员公署。1955年元月，更名为“云阳县人民委员会”；是年5月，属万县专员公署。1969年10月，更称“云阳县革命委员会”，隶万县地区革命委员会。1981年4月恢复“云阳县人民政府”称谓，属万县地区行政公署。1992年12月，改属万县市。1997年3月，全国人民代表大会通过成立重庆直辖市。是年7月18日，重庆直辖市人民政府成立，云阳改由万州移民开发区政府代管。1999年9月28日，县治从云阳镇迁至新县城双江镇。2000年7月14 日，直属重庆直辖市管辖至2005年。